骨架提取与分水岭算法也属于形态学处理范畴,都放在morphology子模块内。
1、骨架提取
骨架提取,也叫二值图像细化。这种算法能将一个连通区域细化成一个像素的宽度,用于特征提取和目标拓扑表示。
morphology子模块提供了两个函数用于骨架提取,分别是Skeletonize()函数和medial_axis()函数。我们先来看Skeletonize()函数。
格式为:skimage.morphology.skeletonize(image)
输入和输出都是一幅二值图像。
例1:
from skimage import morphology,drawimport numpy as npimport matplotlib.pyplot as plt#创建一个二值图像用于测试image = np.zeros((400, 400))#生成目标对象1(白色U型)image[10:-10, 10:100] = 1image[-100:-10, 10:-10] = 1image[10:-10, -100:-10] = 1#生成目标对象2(X型)rs, cs = draw.line(250, 150, 10, 280)for i in range(10): image[rs + i, cs] = 1rs, cs = draw.line(10, 150, 250, 280)for i in range(20): image[rs + i, cs] = 1#生成目标对象3(O型)ir, ic = np.indices(image.shape)circle1 = (ic - 135)**2 + (ir - 150)**2 < 30**2circle2 = (ic - 135)**2 + (ir - 150)**2 < 20**2image[circle1] = 1image[circle2] = 0#实施骨架算法skeleton =morphology.skeletonize(image)#显示结果fig, (ax1, ax2) = plt.subplots(nrows=1, ncols=2, figsize=(8, 4))ax1.imshow(image, cmap=plt.cm.gray)ax1.axis('off')ax1.set_title('original', fontsize=20)ax2.imshow(skeleton, cmap=plt.cm.gray)ax2.axis('off')ax2.set_title('skeleton', fontsize=20)fig.tight_layout()plt.show()
生成一幅测试图像,上面有三个目标对象,分别进行骨架提取,结果如下:
例2:利用系统自带的马图片进行骨架提取
from skimage import morphology,data,colorimport matplotlib.pyplot as pltimage=color.rgb2gray(data.horse())image=1-image #反相#实施骨架算法skeleton =morphology.skeletonize(image)#显示结果fig, (ax1, ax2) = plt.subplots(nrows=1, ncols=2, figsize=(8, 4))ax1.imshow(image, cmap=plt.cm.gray)ax1.axis('off')ax1.set_title('original', fontsize=20)ax2.imshow(skeleton, cmap=plt.cm.gray)ax2.axis('off')ax2.set_title('skeleton', fontsize=20)fig.tight_layout()plt.show()
medial_axis就是中轴的意思,利用中轴变换方法计算前景(1值)目标对象的宽度,格式为:
skimage.morphology.medial_axis(image,mask=None,return_distance=False)
mask: 掩模。默认为None, 如果给定一个掩模,则在掩模内的像素值才执行骨架算法。
return_distance: bool型值,默认为False. 如果为True, 则除了返回骨架,还将距离变换值也同时返回。这里的距离指的是中轴线上的所有点与背景点的距离。
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